近日，我校食品科学与工程系特色植物食品研究团队，以第一单位第一作者在植物科学领域国际知名期刊《BMC Plant Biology》（IF: 4.960，JCR 1 区，中国科学院2区）发表题为“TeaPVs: a comprehensive genomic variation database for tea plant (Camellia sinensis)”的研究论文。该论文的第一作者和通讯作者分别为安焱林博士和张丰博士，食工系张小勤老师、蒋思峡老师和赵晶晶老师参与部分研究工作。该研究得到遵义市校联合基金项目和国家自然基金项目的共同支持。

植物基因组变异不仅在调控植物表型和适应性进化中扮演重要作用，而且丰富了其种群遗传多样性并参与调控基因表达。茶树（Camellia sinensis）具有一套较大的基因组（~3.0 Gb），这使得全基因组变异位点的鉴定既耗时又昂贵。随着大量测序数据的不断发布，尚缺乏一个开放的平台来整合这些数据并对群体变异位点进行鉴定分析。

本研究共收集了238个茶树全基因组重测序、213个转录组测序和96个杂交F1个体样本超过20 Tb的测序数据进行突变位点的鉴定分析；基于鉴定到的变异信息，该团队构建了首个茶树群体变异Web服务数据库TeaPVs（http://47.106.184.91:8025/）。该平台支持用户根据位置信息或基因ID搜索所有SNP，Indel，SV突变和SSR位点，并提供不同转录组的基因表达水平搜索、基因组任意位置序列提取和下载等功能。

贵州省作为我国茶树种植大省，茶产业在脱贫攻坚和乡村振兴中起着非常重要的作用。本研究致力于茶树生物信息学研究，该平台的发布将为茶树分子标记辅助育种和基因突变位点分析提供有力支撑。(供稿/食品科学与工程系）